у меня похожее было, стук появился в коробке после заваривания маховика, стук проявлялся на х.х. при сильно прогретом масле в коробке (замена масла не помогла) и слышно его было за левым колесом, а ещё стук проявлялся при разгоне (как будто прокладка выпускной системы прогорела)
недавно поменял маховик, стук исчез...
но плавность, мягкость и безшумность длилось около недели
потом стали появляться стуки на х.х. (другие...) скорее всего от маховика...
маховик брал SACHS 6366 000 001, кстати в коробке лежал маховик фирмы GAT, то же что и в оригинале, люфт был
p.s. когда менял маховик решил раскидать коробку, так вот состояние коробки было идеальное (пробег 203 тык, если не скручен), собирал отдельно с каждым валом, всё крутиться отлично, без зазоров