подшипник у тебя не люфтит? Когда тормозишь, диск колодками зажимает и поэтому не бьет.
Еще может тормозной дурить, поршень может заедает. Не похоже на диски, если бы они были кривыми, то колбасило бы и со старыми и с новыми.
Кстати, на всякий случай, толщину дисков проверить бы, вдруг сточились, хотя вряд ли.