Пожалуйста!
При полностью исправном генераторе двигатель глохнуть не должен и ЭБУ ничего не будет, т.к. при полностью исправном генераторе напряжение, выдаваемое генератором, практически никак не зависит от подключения/отключения исправного аккумулятора. А вот если в аккумуляторе пара банок короткозамкнутых или реле-регулятор в генераторе полумёртвый или щётки на излёте, то конечно можно что-нибудь и пожечь...
Да и ЭБУ сжечь не так просто, как кажется. У меня как-то раз на УАЗе коротнула обмотка возбуждения в генераторе - в итоге он потерял способность регулировать напряжение и оно превысило 20 Вольт. Родной Бошевский ЭБУ двигателя даже не обратил внимания на эту поломку и машина продолжила ехать, а установленный ЭБУ электроусилителя руля от Тойоты ушёл в ошибку и самоотключился, а после замены генератора полностью восстановил свою работоспособность. А вот лампочек погорело тогда много.
Естественно, всё вышесказанное относится к автомобилям, в которых реле-регулятор находится в генераторе и схема простая - с двумя проводами на генераторе - это и первое и второе поколение Мондео, как минимум. А вот на более современных авто, где и напряжением генератора зачастую управляет ЭБУ двигателя и могут быть дополнительные провода к клемме аккумулятора для непосредственного замера напряжения на клемме аккумулятора, а то и температуры - могут быть нюансы. Там и я бы лишний раз клемму на заведённом скидывать бы не стал... )))