маленькие можно аккуратно в пластиковом корпусе оставить, а те что пошире, либо обрезать, либо достать и припаять напрямую. Резистор, который там внутри стоит, нужно оставить, ток ограничивает (без него сгорит моментом). Даже порекомендовал бы поменять "на" 100 Ом большего номинала (мультиметром можно глянуть сопротивление). Ну и не забываем про полярность у светодиодов, а-то сначала соберёте, закрутите, а потом проверите а некоторые не горят. Ну и проверяйте, чтобы контакт был чёткий, а-то от дребезга двигателя могут пропадать.