Провалы оборотов после смены двигателя на контрактный...

Доброго вечера, уважаемые форумчане!
Помнится, была проблема на Мондео 4 с пропажей зарядки, которую никак не могли решить, но знающие люди подсказали и проблему решили буквально за час.
Сейчас проблема посложнее, но возможно был у кого-то подобный случай, либо кто-то подскажет направление.
Пойду по хронологии, текста побольше, но и вводных больше, для детального обсуждения вопроса.
2009 год, двиг. 2 литра, атмосфера, пробег 180.
1. Был небольшой масложор на движке, особо не задумывались, подливали, ездили, так как все в один голос говорили, что движок не ремонтируется и проще по факту поменять на контракт. В один из приездов к механику, решили вырезать катализатор (уже было критично). Катализатор вырезали, поставили пламегаситель (без обманки), прошили. Машина стала ехать заметно бодрее, но через небольшое время, машина встала (прогорел клапан). 
2. Решили, что время пришло, заказали контрактный движок. Его привезли, поставили, навесное осталось наше. Так как отец работает вахтами, он его погонял около 500-700 км и пришлось уехать, а значит гарантия по времени прошла. По факту установки все прекрасно, никакого масложора, едет хорошо, проблем серьезных нет. НО, обратили внимание на небольшой нюанс - в рандомных времени, скорости и ситуациях, возникают провалы. Нажимая на педаль газа, обороты не растут. При этом отпуская педаль, машина как будто очнувшись, резко срывается. Такое возникает даже при трогании. Сейчас проблема возникает все чаще и чаще. Также связано это или нет, но обратили внимание на показания расхода в моменте (отец почему-то всегда ставит именно этот показатель). Он стал глючить, не падает, показывает нереальные цифры. Например может на холостом ходу показывать расход в 30, а при нагрузке показания холостого хода.
Что было проверено и сделано:
- Были поменяны все свечи;
- Был поменян шланг на клапан завихрения (оказался надорван), остальные проверены;
- Был снят бензобак, проверен бензонасос, работает штатно;
- Диагностика понятно, по умолчанию, на каждом шаге;

Теперь собственно вопросы:
1) Что может быть причиной этих провалов? Связано ли это с удалением катализатора и прошивки или этот вариант исключен?
2) Смена двигателя - понимаю, что вариантов может быть масса, но может в данном случае что-то могло быть не учтено;
3) Может ли это быть работой какого-нибудь датчика ( на что собственно и грешим) и не являются ли показания моментального расхода как раз ниточкой к нему?

Любой помощи буду рад, заранее спасибо за отзыв!

UPD. Позвонили в сервис города, который вроде как специализируется на фордах, говорят, что все признаки указывают на бензонасос. Теория рабочая, пару лет назад меняли на оригинал, т.к. машина глохла на жаре при его перегреве, но странно что проблема вылезла так быстро.

Еще советуют проверить на дым машине, чтобы исключить возможный подсос воздуха на магистрали.

Хотелось бы еще услышать мнения, может будут также интересные направления.

@DarkDeath Откатывайте на сток софт и проверяйте дальше.

@Евген2115 

Добрый вечер! Понял, тогда два вопроса:

1) Сколько на сток софте проверять? Введь после удаления каталика, как я понимаю, это неправильно.

2) Если проблема уйдет, какие варианты прошивки рассматривать?

@DarkDeath 

Потестируйте некоторое время. Если проблема в железе, то сразу будет понятно. 
прошивка нужна качественная)

@Евген2115 А если не брать в расчет проблему прошивки? Отец говорит, что после удаления каталика и прошивки, такой проблемы не было, появилась после установки контрактного движка. Куда в первую очередь копать или тут вариантов уже намного больше?

@DarkDeath если нет вариантов диагностики, то самое оптимальное вернуть сток и понаблюдать. 

@Евген2115 В том то и дело, может и есть, но даже сразу после провала, возвращаясь в сервис к диагносту, ошибок текущих и в истории, не показывает. Может конечно диагностика еще такая себе. Просто он в другом городе, в регионе, сложно проверить. В любом случае спасибо за способ! Буду держать в курсе

@DarkDeath даже если нет кодов неисправности, нужно смотреть текущие показания с датчиков. 
Ждем новостей)