Ну первое, что я вижу - непрофессионализм дилера. До их вмешательства была проблема - тек сальник, после их вмешательства - не работает АКПП. Как я себе вижу суть, дилер сломал АКПП и должен все починить за свой счет.
Второе - для замены сальника сцепление снимать не нужно.
Третье. Если сцепление таки снимали и после съема от маховика откололся зуб, то есть вероятность, что сцепление на место ставили кувалдой и могли повредить как само сцепление, так и вал коробки, который отвечает за нечетные передачи. Тут уже без полной разборки и дефектовки не разберешься.
В любом случае, я бы настаивал на том, что дилер при замене сальника сломал коробку и должен ее починить за свой счет. Если дилер Вашу позицию не примет, писать в представительство Форд в России и прилагать копии всех заказ-нарядов.