Протекание дверей известная проблема для ФМ3. В указанных выше ссылках на эти темы все детально обсуждается!
Если снимешь обшивку двери и с внешней стороны польешь на стекло двери, то увидишь как именно вода находит себе путь.
Обычно либо уплотнитель серый немного отходит снизу или через технологические отверстия брызжет на обшивку, ну а потом на порог и в салон. Самый действенный способ - сделать экран внутри двери как описано в указанных выше темах.
У меня протекала задняя правая дверь, потратил часа 2 на работу, вскрыл дверь, пришлось немного срезать серый уплотнитель от двери, клеить экран от верхней кромки двери, там где заканчивается стекло и до водоотводов (дырок внизу двери).
Помогло на 100%, но немного муторно, потому что пространства в двери мало - подлезть трудно. Удачи!